MU と違うのは、インストール後に「手動」でマルチ化をしなければならない点。
「wp-config.php」に以下の分を追加してアップロード。

define( ‘WP_ALLOW_MULTISITE’, true);

「wp-config.php」を再アップロードすると、
「ツール」のところに「Network」というのが出てマルチ化のためにする作業が表示される。

「wp-content」のフォルダに「blogs.dir」を作成する。
表示されるコードを「wp-config.php」に追加しアップロードする。
表示された「.htacsess」を作成しアップロードする。

これでマルチ化の完了。そんなに手間はかからない。

普通に 3.0 をインストールすると「変更をプレビュー」でちゃんと変更されたものがプレビューされるけど、
2.9x からの自動アップデートでは「下書きとして保存」後でなければ変更は認識されない模様。

テストサイト↓
オリジナル 3.0（サブドメイン）　→　http://wp3.test-0.com/
サブサブドメインでの追加ブログ　→　http://sub1.wp3.test-0.com/

以上【CORE SERVER】での【WordPress】3.0 の感想でした。